Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT80Q6KB66 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms