Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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