Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC27A3Q5K4L6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms