Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP10Q15642 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms