Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms