Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms