Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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