Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms