Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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NCOA4Q13772 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCOA4Q13772 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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