Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms