Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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