Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms