Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms