Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms