Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms