Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms