Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms