Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms