Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms