Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1313.8 ms