Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms