Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HBBP68871 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HBBP68871 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HBBP68871 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HBBP68871 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HBBP68871 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HBBP68871 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms