Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms