Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA9P57773 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms