Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms