Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms