Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms