Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RECQLP46063 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms