Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms