Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRBP23467 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms