Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms