Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms