Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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