Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA5P20719 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms