Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPB42P16452 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPB42P16452 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms