Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms