Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00032P0C843 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms