Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYNP07948 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYNP07948 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYNP07948 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYNP07948 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210 ms