Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP2O95045 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP2O95045 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP2O95045 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP2O95045 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP2O95045 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms