Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PCH4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PCH4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PCH4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PCH4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms