Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms