Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms