Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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