Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms