Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms