Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
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