Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms