Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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