Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms