Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM198BQ6UWH4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms